A organização curricular do curso de Medicina Veterinária da UNIPAMPA é constituída por componentes curriculares obrigatórios (currículo fixo) e componentes curriculares complementares (currículo flexível), perfazendo 4320 horas. O currículo fixo é composto por 63 componentes curriculares, distribuídos ao longo de nove semestres sequenciais, com características teóricas (2115 horas) e práticas (1320 horas), totalizando 3435 horas, além do estágio curricular supervisionado realizado no último semestre (10º semestre), com 540 horas de duração. Por sua vez, o currículo flexível é composto por Atividades Complementares de Graduação (ACGs) e Componentes Curriculares Complementares de Graduação (CCCGs).

Para integralização curricular, com vistas à colação de grau no referido curso, o acadêmico deverá ter aprovação de todo currículo fixo proposto, assim como mínimo de 120 horas em CCCGs, além de comprovar mínimo de 225 horas em ACGs, das quais no mínimo 10% e máximo 40% em cada uma das quatro classes de ACGs. Ainda assim, é válido salientar que em conformidade com a lei 10.861/2004, a realização do Exame Nacional de Avaliação e Desempenho de Estudante (ENADE) integra a parte obrigatória do currículo, condicionante à colação de grau.