O PROFMAT Caçapava do Sul possui as seguintes Comissões Acadêmicas:

Comissão Acadêmica Institucional (Conselho do PROFMAT)

Descrição: é a comissão de curso do PROFMAT, formada pelos docentes permanentes, um representante discente e um representante técnico-administrativo em educação

Membros: 
Leugim Corteze Romio (coordenador)
Vitalino Cesca Filho (coordenador substituto)
Aline Lopes Balladares (docente permanente)
Igor Antônio Cancela Melnik (docente permanente)
Maria Arlita da Silveira Soares (docente permanente)
Maria Lúcia Pozzati Flores (docente permanente)
Moisés Razeira (docente permanente)
Osmar Francisco Giuliani (docente permanente)
Vinícius de Abreu Oliveira (docente permanente)
Cristina Brito Oliveira (representante TAE)
Leonardo Seelig (representante discente)

Comissão coordenadora

Descrição: a comissão coordenadora supervisiona, administra e coordena as atividades relativas ao curso.

Membros:
Leugim Corteze Romio (coordenador)
Vitalino Cesca Filho (coordenador substituto)
<em atualização> (representante  docente)
Maria Arlita da Silveira Soares (representante docente)
Cristina Brito Oliveira (representante TAE)
Leonardo Seelig (representante discente)

Comissão de bolsas

Descrição: é a comissão responsável pelo gerenciamento das bolsas de estudos

Membros:
Leugim Corteze Romio (coordenador)
Maria Arlita da Silveira Soares (representante docente)
Leonardo Seelig (representante discente)

Comissão de seleção

Descrição: A cada processo de seleção para ingressantes no programa, constitui-se nova comissão, que coordena e conduz o processo.

Membros (comissão de seleção ENA 2022):
Aline Lopes Balladares
Leugim Corteze Romio
Vitalino Cesca Filho