O PROFMAT Caçapava do Sul possui as seguintes Comissões Acadêmicas:

Comissão Acadêmica Institucional (Conselho do PROFMAT)

Descrição: é a comissão de curso do PROFMAT, formada pelos docentes permanentes, um representante discente e um representante técnico-administrativo em educação

Membros: 
Leugim Corteze Romio (coordenador)
Vitalino Cesca Filho (coordenador substituto)
Aline Lopes Balladares (docente permanente)
Igor Antônio Cancela Melnik (docente permanente)
Maria Arlita da Silveira Soares (docente permanente)
Maria Lúcia Pozzati Flores (docente permanente)
Moisés Razeira (docente permanente)
Reginaldo Fabiano da Silva Afonso (Docente Colaborador)
Liliana Cassol dos Santos (representante TAE)
— (representante discente)

Comissão coordenadora

Descrição: a comissão coordenadora supervisiona, administra e coordena as atividades relativas ao curso.

Membros:
Leugim Corteze Romio (coordenador)
Vitalino Cesca Filho (coordenador substituto)
Maria Arlita da Silveira Soares (representante docente)
Moisés Razeira (docente permanente)
Liliana Cassol dos Santos (representante TAE)
— (representante discente)

Comissão de bolsas

Descrição: é a comissão responsável pelo gerenciamento das bolsas de estudos

Membros:
Leugim Corteze Romio (coordenador)
Maria Arlita da Silveira Soares (representante docente)
— (representante discente)

Comissão de seleção

Descrição: A cada processo de seleção para ingressantes no programa, constitui-se nova comissão, que coordena e conduz o processo.

Membros (comissão de seleção ENA 2023):
Aline Lopes Balladares
Leugim Corteze Romio
Vitalino Cesca Filho